Willkommen bei GREENGATE GENOMICS

Bioinformatische
Lösungen

f√ľr komplexe mikrobiologie

√úber
GREENGATE GENOMICS

GreenGate Genomics ist ein Bioinformatik-Dienstleistungs-Startup, das sich auf mikrobielle und umweltbezogene Genomik spezialisiert hat. Gegr√ľndet im Jahr 2023 von f√ľnf Forschern am Deutschen GeoForschungsZentrum GFZ, hat GreenGate Genomics die Mission, die Entschl√ľsselung und Analyse mikrobieller genetischer Daten einfacher, zug√§nglicher und anwendbarer zu machen. Bestehend aus einem Team von erfahrenen Bioinformatikern und molekularen Mikrobiologen nutzen wir fortschrittliche, hochmoderne Techniken und Arbeitsabl√§ufe, um eine umfassende Analyse und Interpretation mikrobieller genomischer Daten zu erm√∂glichen. Die individuell anpassbaren Produkte und Dienstleistungen von GreenGate Genomics richten sich an die Bed√ľrfnisse von Wissenschaftlern, Forschern, Biotechnologieunternehmen oder medizinischen Fachkr√§ften und erm√∂glichen diesen Einblicke in die oft komplexe Landschaft mikrobieller Vielfalt und Prozesse.

GREENGATE GENOMICS
Produkte und Dienstleistungen

GreenGate Genomics bietet Produkte und Dienstleistungen im Bereich genomischer und bioinformatischer Analysen mit besonderer Expertise in Mikrobiologie und Molekularbiologie an. 

favico

GreenGate unterst√ľtzt Wissenschaftler, Institute und Unternehmen durch ma√ügeschneiderte genomsiche und bioinformatische Datenanalysen, die Erstellung von Analyse-Workflows und -Pipelines und/oder die Entwicklung und Durchf√ľhrung von bioinformatischen Schulungen und Workshops.

Amplikon Datenanalyse

DNA basierend

  • Barcode/Primer Design 
  • Quality Control Workflows
  • ASV/OTU Bestimmung
  • Taxonomische Auswertung
  • Markergenanalyse

Oxford Nanopore Daten

DNA basierend

  • Sequenzierung
  • Akkurates Basecalling
  • Errorkorrektur
  • Genomassemblierung
  • Metagenomische Analyse

Illumina Daten

DNA basierend

  • Rohdaten Bearbeitung (paired-end / single-end)
  • (Co-)assemblierung von Sequenzen und Fragmenten
  • Metagenomische Analyse
  • Annotation

METATRANSKriptom Analysen

RNA basierende Analysen

  • Rohdatenauswertung und Qualit√§tscheck
  • Assemblierung und Generkennung
  • Funktionale und Taxonomische Annotation von Genen
  • Differential Expression

Beratung und Weiterbildung

Projektspezifische Unters√ľtzung

  • Beratung zum experimentellen Design
  • Projektspezifische Sequenzierberatung
  • Empfehlung von Datenanalyse Strategien
  • Weiterbildungen und Workshops

Datenvisualisierung und Biostatistik

Tiefe Datenanalyse

  • Individuell anpassbare Abbildungen und graphische Darstellungen¬†
  • Rarefaction and Rank Abundance Curves
  • Alpha/Beta Diversit√§tsanalyse
  • Bestimmung von Indikatormikroorganismen
  • Generalisten und Spezialisten Analyse

GREENGATE GENOMICS
TEAM

Alexander Bartholomäus
Chief Execution Officer (CEO)
Sizhong Yang
Chief Technical Officer (CTO)
Daniel Lipus
Chief Customer Officer (CCO)
Susanne Liebner
Scientific Advisor
Dirk Wagner
Scientific Advisor

Finde mehr √ľber unser Team heraus!

GREENGATE GENOMICS
FALLSTUDIEN

Wir bei GreenGate Genomics verf√ľgen √ľber umfassendes Fachwissen im Bereich der mikrobiellen Umweltgenomik. Einige der Projekte, an denen wir teilgenommen haben, sind unten aufgef√ľhrt. Unsere Arbeit wurde auch in zahlreiche Forschungsartikeln in renommierten wissenschaftlichen Fachzeitschriften ver√∂ffentlicht. Diese Finden Sie auf unserer Ver√∂ffentlichungsliste.