Willkommen bei GREENGATE GENOMICS

Bioinformatische
Lösungen

für komplexe mikrobiologie

+++NEWS+++ GreenGate Genomics was one of six finalists for the Brandenburger Innovationspreis 2024. Learn more here.

Über
GREENGATE GENOMICS

GreenGate Genomics ist ein Bioinformatik-Dienstleistungs-Startup, das sich auf mikrobielle Umweltgenomik spezialisiert hat. Gegründet im Jahr 2023 von fünf Forschern am GFZ Deutsches GeoForschungsZentrum, widmen wir uns der Entschlüsselung mikrobieller genetischer Daten. Mit einem Team aus erfahrenen Bioinformatikern und molekularen Mikrobiologen nutzen wir präzise und hochmoderne Methoden und Arbeitsabläufe, um umfassende Analysen und Interpretationen mikrobieller Genome anzubieten. Unsere maßgeschneiderten Dienstleistungen richten sich an die individuellen Bedürfnisse von Wissenschaftlern, Forschern, Unternehmen und dem Gesundheitswesen und bieten vielfältige Einblicke in die Komplexität mikrobieller Systeme.

GreenGate unterstützt Wissenschaftler, Institute und Unternehmen durch maßgeschneiderte genomsiche und bioinformatische Datenanalysen, die Erstellung von Analyse-Workflows und -Pipelines und/oder die Entwicklung und Durchführung von bioinformatischen Schulungen und Workshops.

GreenGate Genomics bietet Produkte und Dienstleistungen im Bereich genomischer und bioinformatischer Analysen mit besonderer Expertise in Mikrobiologie und Molekularbiologie an. 

favico

GreenGate unterstützt Wissenschaftler, Institute und Unternehmen durch maßgeschneiderte genomsiche und bioinformatische Datenanalysen, die Erstellung von Analyse-Workflows und -Pipelines und/oder die Entwicklung und Durchführung von bioinformatischen Schulungen und Workshops.

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GREENGATE GENOMICS
Produkte und Dienstleistungen

Amplikon Datenanalyse

DNA basierend

  • Barcode/Primer Design 
  • Quality Control Workflows
  • ASV/OTU Bestimmung
  • Taxonomische Auswertung
  • Markergenanalyse

Oxford Nanopore Daten

DNA basierend

  • Sequenzierung
  • Akkurates Basecalling
  • Errorkorrektur
  • Genomassemblierung
  • Metagenomische Analyse

Illumina Daten

DNA basierend

  • Rohdaten Bearbeitung (paired-end / single-end)
  • (Co-)assemblierung von Sequenzen und Fragmenten
  • Metagenomische Analyse
  • Annotation

METATRANSKriptom Analysen

RNA basierende Analysen

  • Rohdatenauswertung und Qualitätscheck
  • Assemblierung und Generkennung
  • Funktionale und Taxonomische Annotation von Genen
  • Differential Expression

Beratung und Weiterbildung

Projektspezifische Untersützung

  • Beratung zum experimentellen Design
  • Projektspezifische Sequenzierberatung
  • Empfehlung von Datenanalyse Strategien
  • Weiterbildungen und Workshops

Datenvisualisierung und Biostatistik

Tiefe Datenanalyse

  • Individuell anpassbare Abbildungen und graphische Darstellungen 
  • Rarefaction and Rank Abundance Curves
  • Alpha/Beta Diversitätsanalyse
  • Bestimmung von Indikatormikroorganismen
  • Generalisten und Spezialisten Analyse

GREENGATE GENOMICS
TEAM

Alexander Bartholomäus
Chief Execution Officer (CEO)
Sizhong Yang
Chief Technical Officer (CTO)
Daniel Lipus
Chief Customer Officer (CCO)
Susanne Liebner
Scientific Advisor
Dirk Wagner
Scientific Advisor

Finde mehr über unser Team heraus!

GREENGATE GENOMICS
FALLSTUDIEN

Wir bei GreenGate Genomics verfügen über umfassendes Fachwissen im Bereich der mikrobiellen Umweltgenomik. Einige der Projekte, an denen wir teilgenommen haben, sind unten aufgeführt. Unsere Arbeit wurde auch in zahlreiche Forschungsartikeln in renommierten wissenschaftlichen Fachzeitschriften veröffentlicht. Diese Finden Sie auf unserer Veröffentlichungsliste.