Willkommen bei GREENGATE GENOMICS
Bioinformatische
Lösungen
für komplexe mikrobiologie
Über
GREENGATE GENOMICS
GreenGate Genomics is a cutting-edge bioinformatic service startup specializing in microbial and environmental genomics. Founded in 2023 by five researchers at the GFZ German Research Center for Geosciences, we are at the forefront of deciphering the world of microbial genetic data. With a team of skilled bioinformaticians and molecular microbiologists, we utilize advanced, state-of-the-art techniques and workflows to provide comprehensive analysis and interpretation of microbial genomes. Our tailored services cater to the unique needs of academic researchers, biotech companies, and healthcare professionals, equipping them with invaluable insights into the complexities of microbial systems
GreenGate Genomics bietet Produkte und Dienstleistungen im Bereich genomischer und bioinformatischer Analysen mit besonderer Expertise in Mikrobiologie und Molekularbiologie an.
GreenGate unterstützt Wissenschaftler, Institute und Unternehmen durch maßgeschneiderte genomsiche und bioinformatische Datenanalysen, die Erstellung von Analyse-Workflows und -Pipelines und/oder die Entwicklung und Durchführung von bioinformatischen Schulungen und Workshops.
GREENGATE GENOMICS
Produkte und Dienstleistungen
Amplikon Datenanalyse
DNA basierend
- Barcode/Primer Design
- Quality Control Workflows
- ASV/OTU Bestimmung
- Taxonomische Auswertung
- Markergenanalyse
Oxford Nanopore Daten
DNA basierend
- Sequenzierung
- Akkurates Basecalling
- Errorkorrektur
- Genomassemblierung
- Metagenomische Analyse
Illumina Daten
DNA basierend
- Rohdaten Bearbeitung (paired-end / single-end)
- (Co-)assemblierung von Sequenzen und Fragmenten
- Metagenomische Analyse
- Annotation
METATRANSKriptom Analysen
RNA basierende Analysen
- Rohdatenauswertung und Qualitätscheck
- Assemblierung und Generkennung
- Funktionale und Taxonomische Annotation von Genen
- Differential Expression
Beratung und Weiterbildung
Projektspezifische Untersützung
- Beratung zum experimentellen Design
- Projektspezifische Sequenzierberatung
- Empfehlung von Datenanalyse Strategien
- Weiterbildungen und Workshops
Datenvisualisierung und Biostatistik
Tiefe Datenanalyse
- Individuell anpassbare Abbildungen und graphische Darstellungen
- Rarefaction and Rank Abundance Curves
- Alpha/Beta Diversitätsanalyse
- Bestimmung von Indikatormikroorganismen
- Generalisten und Spezialisten Analyse
GREENGATE GENOMICS
FALLSTUDIEN
Wir bei GreenGate Genomics verfügen über umfassendes Fachwissen im Bereich der mikrobiellen Umweltgenomik. Einige der Projekte, an denen wir teilgenommen haben, sind unten aufgeführt. Unsere Arbeit wurde auch in zahlreiche Forschungsartikeln in renommierten wissenschaftlichen Fachzeitschriften veröffentlicht. Diese Finden Sie auf unserer Veröffentlichungsliste.