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Möchtest du mehr über die Mikroorganismen in deiner Probe erfahren? Erfahre mehr über verschiedene Optionen, um die beste Lösung für dich zu finden.

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Bioinformatik für Sequenzdaten ist unsere Passion. Kontaktiere uns, um zu erfahren, wie wir dir helfen können.

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Von Amplicon-PCR, über kostengünstige Sequenzierung bis hochwertige Analysen. Wir sind der perfekte Partner für dein Amplicon-Projekt.

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Du planst dein Experiment um Sequenzierkosten und Analysequalität zu optimieren? Du brauchst einen maßgeschneiderten Bioinformatik-Service oder spezielle Software? Lass uns die Details besprechen! 

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Über
GREENGATE GENOMICS

GreenGate Genomics ist ein Bioinformatik-Dienstleistungs-Startup, das sich auf mikrobielle Umweltgenomik spezialisiert hat. Gegründet im Jahr 2023 von fünf Forschern am GFZ Deutsches GeoForschungsZentrum, widmen wir uns der Entschlüsselung mikrobieller genetischer Daten. Mit einem Team aus erfahrenen Bioinformatikern und molekularen Mikrobiologen nutzen wir präzise und hochmoderne Methoden und Arbeitsabläufe, um umfassende Analysen und Interpretationen mikrobieller Genome anzubieten. Unsere maßgeschneiderten Dienstleistungen richten sich an die individuellen Bedürfnisse von Wissenschaftlern, Forschern, Unternehmen und dem Gesundheitswesen und bieten vielfältige Einblicke in die Komplexität mikrobieller Systeme. ist ein innovatives Bioinformatik-Startup, spezialisiert auf mikrobielle und umweltbezogene Genomik. Das Unternehmen wurde 2023 von fünf Forschenden des GFZ Helmholtz-Zentrum für Geoforschung. Wir sind ganz vorn beim Entziffern der Welt der mikrobiellen genetischen Daten. Mit einem Team aus erfahrenen Bioinformatiker:innen und Molekularbiolog:innen nutzen wir fortschrittliche, hochmoderne Techniken und Arbeitsabläufe, um umfassende Analysen und Interpretationen mikrobieller Genome anzubieten. Unsere maßgeschneiderten Services sind auf die Bedürfnisse vn akademischen Forschenden, Biotech-Unternehmen und Fachleuten im Gesundheitswesen zugeschnitten und liefern wertvolle Einblicke in die Komplexität mikrobieller Systeme.

GREENGATE GENOMICS
TEAM

Alexander Bartholomäus
Alexander Bartholomäus
Chief Execution Officer (CEO)
Tom Janetzek
Tom Janetzek
Chief Technical Officer (CTO)
Daniel Lipus
Daniel Lipus
Chief Customer Officer (CCO)
Susanne Liebner
Susanne Liebner
Scientific Advisor
Dirk Wagner
Dirk Wagner
Scientific Advisor

Finde mehr über unser Team here!

GREENGATE GENOMICS
FALLSTUDIEN

Wir bei GreenGate Genomics verfügen über umfassendes Fachwissen im Bereich der mikrobiellen Umweltgenomik. Einige der Projekte, an denen wir teilgenommen haben, sind unten aufgeführt. Unsere Arbeit wurde auch in zahlreiche Forschungsartikeln in renommierten wissenschaftlichen Fachzeitschriften veröffentlicht. Diese Finden Sie auf unserer Veröffentlichungsliste.

OilandGas_FeatureImages

Oil and Gas Ecology

Evaluation of microbial abundance and composition patterns highlighted elevated potential for biocorrosion and well fouling. Statistical assessment suggested a link between biocide usage and microbial distribution. Reconstruction and characterization of draft genomes provided insights into microbial processes in oil and gas environments
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Methane-Cycling Microbiome in Permafrost

Taxonomic and functional profiling revealed high diversity of methane cycling microbiome residing in permafrost soil, with heterogeneous distribution patterns in active layer and permafrost. Diversity loss after excessive warming will lead to larger variability of production rate of greenhouse gas CH4 and CO2 from permafrost soils
DeepBiosphere_FeatureImages

Deep Biosphere

Specifically adapted laboratory and bioinformatic workflows allowed the reconstruction of microbial distribution patterns down to a depth of 230 m across this, difficult to work with, low biomass environment. Metagenomic genome recovery allowed the detection and characterization of CO2 utilizing methangenic and chemolithotrophic mcirroganismans. Statistical evaluation provided insights into microbial co-occurrence patterns and bio-geo interactions.
BiocideResistenc_FeatureImages

Biocide Resistance

Differential expression analysis resulted in the identification of significantly upand downregulated genes in response to sodium hypochlorite. Following annotation of these genes, results were used to reconstruct cellular pathways which may be used by Pseudomonas biofilm cells to develop resistance to oxidative biocides.
Atacama_FeatureImages

Atacama Desert

Evaluating the extracellular and intracellular DNA fractions in soil and rock samples from different Atacama desert locations, it was possible to identify highly adapted microbial species, investigate their response to extreme arditty and UV exposure, and gather important insights on microbial turnover in Mars like environments.
Nanopore_FeatureImages

Nanopore Genome Sequencing

Oxford Nanopore Technologies (ONT) offers long read sequencing by nanopore sequencing. Long reads are well suited for genome reconstruction, still the workflow requires careful execution of different computational steps from basecalling to binning of final genome. Some steps of this workflow have a high influence on the size and quality of the final genome.