Bioinformatik
Bioinformatik ist unsere Leidenschaft! Wir würden uns freuen, deine Daten zu analysieren und dir genau die Ergebnisse zu liefern, die du benötigst.
Mit unserer bewährten Expertise genomische Daten zu analysieren können wir dir helfen, hochqualitative Resultate zu erziehlen und das beste aus deinen Daten zu holen.
Entdecke unsere Services und Lösungen für Amplikon-, Metagenom- oder Metatranskriptom-Daten oder kontaktiere uns, wenn du spezielle Analyseanforderungen hast oder Bioinformatik-Software benötigen.
Amplikon
Wir bieten verschiedene Pakete für die Aufbereitung von Amplikondaten an. Von der Standardaufbereitung bis hin zur maßgeschneiderten Analyse – hole das Beste aus deinen Daten.
Metagenomics
Die Verarbeitung metagenomischer Daten erfordert Fachwissen und spezielle Hardware. Wir stehen dir gerne zur Seite.
Custom analysis and software
Wir bieten maßgeschneiderte Analysen genauso wie du sie brauchst. Wenn du wiederkehrende Analysen hast, können wir dir eine automatisierte Pipeline oder eine interaktive App kreieren.
Für Kosten und Beispiele, schau dir die jeweiligen Bereiche an.
Amplikon
Illumina Daten
Illumina-Short-Reads werden aufgrund ihrer hohen Qualität und der Verfügbarkeit von Standard-Verarbeitungspipelines am häufigsten verwendet. Wir bieten verschiedene Pakete an:
Basis package umfasst die Standardverarbeitung von 16S-rRNA- oder 18S-rRNA/ITS-Amplikonfragmenten mittels DADA2 sowie die taxonomische Zuordnung unter Verwendung der SILVA-Datenbank oder eines BLAST-basierten Ansatzes. Ein interaktives Dokument ermöglicht die sofortige und intuitive Auswertung der Ergebnisse. Bei 50 oder mehr Proben beträgt der Preis 5 € pro Probe, bei weniger als 50 Proben 7 € pro Probe.
Advanced package bietet maßgeschneiderte Verarbeitung und Analyse
Für mehr Informationen, schau hier!
Nanopore Daten
Amplikondaten aus der Nanopore-Sequenzierung werden aufgrund der Möglichkeit, Amplikonfragmente in voller Länge zu sequenzieren, immer häufiger verwendet. Allerdings können klassische Methoden zur Amplikonverarbeitung aufgrund der höheren Fehlerhäufigkeit nicht angewendet werden. Dies macht das Clustering und die Dereplikation von Reads unmöglich, sodass andere computergestützte Methoden zum Einsatz kommen müssen.
Wir haben verschiedene Tools verglichen und einen optimierten Arbeitsablauf entwickelt. Die Preise für die Bearbeitung richten sich nach der Anzahl der Reads:
- 7 € pro Probe für weniger als 100.000 Reads pro Probe
- 10 € pro Probe für mehr als 100.000 Reads pro Probe
Metagenomics
Die Verarbeitung und Analyse metagenomischer Daten umfasst mehrere aufeinanderfolgende Verarbeitungsschritte und erfordert oft spezielle Hardware. Dank unserer langjährigen Erfahrung und unserer Infrastruktur sind deine Ergebnisse nur einen Klick entfernt. Unsere verschiedene Pakete bieten dir die benötigte Verarbeitung oder die gewünschte Analyse:
Das Base package bietet dir Datenverarbeitung und liefert Contigs, funktional annotierte Gene sowie vollständige MAGs.
Wir bieten auch die Prozessierung von Metatranscriptomic Daten.
Für Informationen und Preise, schau hier!
Custom analysis and software
Habst du einen besonderen Wunsch bezüglich der Analyse deiner Sequenzierungsdaten? Oder benötigst du eine bestimmte Software, um wiederkehrende Aufgaben zu erledigen? Teile uns einfach deine Anforderungen mit!
Custom Analyse
Benötigest du eine spezielle Art von Analyse? Vielleicht benötigest du eine Analyse unter Verwendung eines bestimmten Softwarepakets oder möchtst du eine veröffentlichte Analyse-Pipeline nachstellen? Kontaktiere uns, und wir besprechen die Möglichkeiten!
Spezifische Software oder App
Gibt es einen bestimmten Analyseschritt, der besonders häufig vorkommt? Oder möchtest du deinen Arbeitsablauf optimieren? Wir können dich bei der Automatisierung deiner Analysen unterstützen.
Wir haben auch Erfahrungen mit interaktiven Apps, insbesondere solchen welche entwickelt werden mit R und Shiny. Get in touch und wir diskutieren, wie wir dir helfen können.