Amplicon SERVICES

Wir nutzen eine innovative, selbst entwickelte Technologie um viele Proben zu poolen und zu sequenzieren und bieten modernes bioinformatisches Prozessieren. Das bietet dir kosten-effiziente Amplikon-Sequenzierung, startend mit 20 € pro Probe. 

Es gibt verschiedene Optionen, Projekte mit uns zu realisieren:

  • Du kannst uns die extrahierte DNA deiner Proben senden und wir kümmern uns um die restliche Laborarbeit
  • Wir stellen die Primer für die PCR bereit, und du lieferst uns die PCR-Produkte
  • In unseren Labors ist auch eine DNA-Extraktion möglich, falls du dich auf deine eigentliche Arbeit konzentrieren möchtest
 

Unsere bioinformatische Expertise gibt dir volle Flexibilität bei der Prozessierung und Analyse.  

16S rRNA

Das 16S-rRNA-Gen ist das gängigste Ziel für die Analyse prokaryotischer Mikroorganismen. Wir bieten Sequenzierungen der gängigsten V4- oder V3-V4-Region zu äußerst günstigen Preisen ab 20 € pro Probe an. 

16S rRNA

18S rRNA / ITS

Zur Analyse eukaryotischer Mikroorganismen wird die 18S-rRNA oder die ITS-Region herangezogen. Dank unseres speziellen Sequenzierungssetups können wir Preise ab 20 € pro Probe anbieten. 

18S / ITS

Bioinformatik

Wir bearbeiten deine Amplikon-Proben mit modernsten Methoden für 5 € pro Probe und senden dir ein interaktives Dokument zur Auswertung der Ergebnisse zu. Wenn du eine individuelle Expertenanalyse benötigst, helfen wir dir gerne weiter.

Bioinformatik

Für Kosten und Beispielprojekte, schau im Preise Bereich.

16S rRNA für Prokaryotes

Die gängigsten 16S-rRNA-Zielregionen zur Erfassung ganzer mikrobieller Gemeinschaften sind die V4-Region oder die kombinierte V3-V4-Region. Wir bieten die Sequenzierung beider Regionen an, die bekanntermaßen sehr universell sind. Mit mehr als 5.000 sequenzierten Proben komplexer Gemeinschaften gehört dies zu unseren Standardverfahren.

Für Preisbeispiele, schau unten.

18S rRNA / ITS für Eukaryotes

Für Eukaryoten bieten wir verschiedene Primer-Kombinationen für die 18S-rRNA und die ITS-Region an. Eukaryoten weisen im Allgemeinen eine größere Variabilität auf und umfassen viele verschiedene Taxa-Gruppen. Für einen allgemeinen Überblick ist die 18S-rRNA in der Regel eine gute Wahl. Für Pilze ist die ITS-Region möglicherweise besser geeignet. Wenn Sie sich für Algen interessieren, besteht möglicherweise die Möglichkeit, andere Fragmente zu verwenden, z. B. die UPA-Region.  

Für Preisbeispiele, schau unten.

Bioinformatik

Wir bieten verschiedene Tiefen der bioinformatischen Prozessierung und Analyse an:   

Basic bioinformatische Prozessierung

Das Basic-Paket umfasst unsere Standardverarbeitung unter Verwendung des DADA2-Ansatzes zur Erkennung mikrobieller Taxa. Für 16S- und 18S-rRNA-Amplikons nutzen wir die SILVA-Datenbank, für ITS wenden wir einen BLAST-basierten Ansatz an. 

Bei weniger als 50 Proben pro Projekt berechnen wir 7 € pro Probe. Bei 50 oder mehr Proben berechnen wir 5 € pro Probe. Wenn du Projekte mit 200 oder mehr Proben planst oder mehrere Projekte mit uns durchführen möchtst, können wir dir Sonderkonditionen anbieten.  

Advanced bioinformatische Prozessierung und Analyse

Das Advanced-Paket umfasst alle Funktionen des Basic-Pakets, bietet jedoch mehr Flexibilität hinsichtlich benutzerdefinierter Datenbanken oder spezieller Verarbeitungsparameter. Darüber hinaus enthält das Advanced-Paket …

Custom Bioinformatik

Das Custom-Paket umfasst unser gesamtes Fachwissen und Know-how. Da jedes Projekt individuell ist, ermitteln wir die Kosten im Rahmen eines Gesprächs. Buche ein Meeting hier!


Preise und Beispiele

Sequenzierung - Preise:

Unsere Preise für die Amplikonsequenzierung sind äußerst wettbewerbsfähig; übliche Anbieter verlangen in der Regel 50 bis 70 € oder mehr pro Probe:

  • Unter 50 Proben berechnen wir 30 € pro Probe.
  • Für 50 Proben oder mehr berechnen wir 20 € pro Probe.
  • Für 200+ Proben oder für mehr als ein Projekt bieten wir Sonderkonditionen an. 

Unsere Bearbeitungszeit ist etwas länger, da wir die Proben in größeren Chargen sammeln. 

Bioinformatik - Preise

  • Basic-Paket: <50 Proben für 7€ pro Probe und 50+ Proben für 5€ pro Probe.
  • Advanced-Paket: …

 

Get in touch

Beispiele:

Beispiel 1: 20 Proben 16S rRNA Sequenzierung und Basic Bioinformatik