{"id":43,"date":"2023-06-24T06:09:33","date_gmt":"2023-06-24T06:09:33","guid":{"rendered":"https:\/\/greengate2.h2615055.stratoserver.net\/?page_id=43"},"modified":"2026-02-05T14:41:40","modified_gmt":"2026-02-05T14:41:40","slug":"faqs","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/greengategenomics.com\/de\/faqs\/","title":{"rendered":"FAQs"},"content":{"rendered":"
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GREENGATE GENOMICS<\/span>
\nFrequently Asked Questions<\/h2>\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t
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\n\t\t\t\t\t\t\n\t\t\t\t\t\t\tExpertise\t\t\t\t\t\t<\/a>\n\t\t\t\t\t<\/h3>\n\t\t\t\t\n\t\t\t\t\n\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t
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\u00dcber uns<\/h2>\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t
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GreenGate Genomics ist ein Biotechnologie-Start-up mit Sitz in Potsdam. GreenGate Genomics wurde von einer Gruppe von Wissenschaftlern des traditionsreichen Deutschen Forschungszentrums f\u00fcr Geowissenschaften (GFZ) gegr\u00fcndet und befindet sich in unmittelbarer N\u00e4he auf dem Forschungs- und Wissenschaftscampus Telegrafenberg. Die Mitarbeiter von GreenGate sind hochqualifizierte Bioinformatiker und Mikrobiologen mit besonderer Expertise in den Bereichen Umwelt- und Molekularmikrobiologie.<\/p><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t

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Wir bieten unseren Kunden eine breite Palette an bioinformatischen Dienstleistungen an, die darauf ausgelegt sind, dich bei der Analyse genomischer Daten (Next-Generation-Sequencing) zu unterst\u00fctzen. Dazu geh\u00f6ren Standardanalysen wie die taxonomische Analyse von Amplikondaten oder die metagenomische Assemblierung und das Binning, aber auch vollst\u00e4ndig ma\u00dfgeschneiderte Analyse-Workflows, die wir sorgf\u00e4ltig auf der Grundlage des Datensatzes und der Kundenanforderungen ausw\u00e4hlen. Eine vollst\u00e4ndige Liste unserer Dienstleistungen findst du auf unserer\u00a0Service<\/a>\u00a0- \u00dcbersichtsseite<\/p>

F\u00fcr Kunden, die ihre eigenen Analysen durchf\u00fchren m\u00f6chten, bieten wir eine Vielzahl von Softwarepaketen an, die wir bereitstellen und die mit unserer Unterst\u00fctzung lokal installiert werden k\u00f6nnen. F\u00fcr alle Anfragen nutze bitte unser Kontaktformular oder sende uns eine E-Mail an\u00a0info@greengategenomics.com<\/a><\/p><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t

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Auf der\u00a0Service<\/a>\u00a0listen wir die am h\u00e4ufigsten nachgefragten Arten von bioinformatischen Analysen und Arbeitsabl\u00e4ufen auf. Solltest du die von dir gew\u00fcnschte Analyse dort nicht finden, wende dich mit deiner Nachfrage bitte direkt an uns unter\u00a0info@greengategenomics.com<\/a>\u00a0und wir melden uns so bald wie m\u00f6glich zur\u00fcck.<\/p><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t

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Wenn du bei uns eine bioinformatische Pipeline\/einen Workflow in Auftrag gibst, ist in der Regel eine Schulung enthalten, die dir bei der Installation, Implementierung und Ausf\u00fchrung dieser Tools hilft. Wir stehen dir bei der Fehlerbehebung zur Seite und stellen sicher, dass die gelieferte Pipeline die gew\u00fcnschten Ergebnisse und Ausgabedaten liefert. Je nach dem vereinbarten Leistungspaket aktualisieren wir deine Pipeline regelm\u00e4\u00dfig.<\/p>

Dar\u00fcber hinaus bieten wir individuelle Schulungen f\u00fcr bestimmte Arbeitsabl\u00e4ufe an (z. B. zur Analyse von 16S-Amplikondaten oder zum metagenomischen Binning), um dir den Umgang mit g\u00e4ngigen bioinformatischen Analysemethoden zu erleichtern. Bitte kontaktiere uns mit deiner Anfrage, um mehr \u00fcber diesen Service zu erfahren und ein Angebot zu erhalten.<\/p>

Schlie\u00dflich bietet GreenGate Genomics regelm\u00e4\u00dfig Workshops zu relevanten Themen der Bioinformatik an. Folge uns auf Twitter unter @greengategenom oder besuche unsere Website, um Ank\u00fcndigungen und unseren Workshop-Kalender einzusehen.<\/p><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t

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Ja, wir bieten dir eine erste Beratung dazu an, welche bioinformatischen Analysen f\u00fcr dein Projekt geeignet sind und wie diese am besten umgesetzt werden k\u00f6nnen. Wir erstellen dir Kosten- und Zeitvoranschl\u00e4ge und f\u00fchren sogar erste Datenanalysen durch, um deine Hypothesen zu untermauern.<\/p>

Wir k\u00f6nnen auch Methodenteile erstellen, in denen bioinformatische Analysen beschrieben werden, die im Rahmen eines Manuskripts durchgef\u00fchrt wurden oder im Rahmen eines zuk\u00fcnftigen Projekts durchgef\u00fchrt werden sollen. Dar\u00fcber hinaus beraten wir dich gerne dazu, wie du deine Genomdaten in einem Manuskript f\u00fcr die Ver\u00f6ffentlichung in einer Fachzeitschrift mit Peer-Review am besten darstellen und interpretieren kannst.<\/p><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t

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Mit dem Aufkommen von Next-Generation-Sequencing haben sich Genomanalysen zu einem der wichtigsten Werkzeuge der modernen Mikrobiologie entwickelt, was dazu f\u00fchrt, dass t\u00e4glich riesige Mengen an Genomsequenzierungsdaten anfallen. Doch w\u00e4hrend die Sequenzierung von genetischem Material einfacher und kosteng\u00fcnstiger geworden ist, bleibt die genaue Analyse der generierten Sequenzierungsdaten einer der gr\u00f6\u00dften Engp\u00e4sse in diesem Forschungsbereich. F\u00fcr die korrekte Verarbeitung genomischer Daten und die Erzielung hochwertiger Ergebnisse, die f\u00fcr wissenschaftliche Publikationen, Berichte und Diagnosen geeignet sind, sind spezielle bioinformatische Fachkenntnisse und Erfahrung erforderlich. Angesichts der un\u00fcberschaubaren Vielzahl an Programmen, Software und Skripten, die in verschiedenen Repositorien und auf verschiedenen Websites verf\u00fcgbar sind, stellt die Auswahl der richtigen Analysestrategie f\u00fcr Laien eine gro\u00dfe Herausforderung dar.<\/p>

Mit den Experten von GreenGate Genomics an Ihrer Seite kannst du sicher sein, dass du das Beste aus deinen Genomdaten herausholst. Mit unserem Know-how k\u00f6nnen wir dein Projekt gezielt unterst\u00fctzen, die am besten geeignete Analysestrategie entwickeln und die n\u00fctzlichsten bioinformatischen Werkzeuge ausw\u00e4hlen. Wir halten uns stets auf dem neuesten Stand der sich rasch wandelnden Landschaft der bioinformatischen Tools, damit unsere Kunden:innen sicher sein k\u00f6nnen, dass ihre Daten mit den genauesten, wissenschaftlich erprobten und anerkannten Workflows und Softwarel\u00f6sungen analysiert werden.<\/p><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t

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Die Einstellung eines Experten auf dem Gebiet der Bioinformatik scheint der erste Gedanke zu sein, wenn Genomdaten analysiert werden m\u00fcssen, ohne dass intern entsprechendes Fachwissen vorhanden ist. Es gibt jedoch mehrere Gr\u00fcnde, warum die Auslagerung dieses Analyseschritts und die Zusammenarbeit mit\u00a0GreenGate Genomics<\/strong>\u00a0die bessere Wahl sein k\u00f6nnte.<\/p>

  1. Die Einstellung eines gut qualifizierten Bioinformatikers in Vollzeit kann kostspielig sein. Neben den Kosten f\u00fcr Gehalt und Personalbeschaffung muss auch ein geeigneter Arbeitsplatz (B\u00fcro, Computerhardware und -software) ber\u00fccksichtigt werden<\/li>
  2. Bei einer ZUsammenarbeit mit\u00a0GreenGate Genomics<\/strong>zahlst du nur f\u00fcr die Analysen, die du tats\u00e4chlich ben\u00f6tigst, und zwar genau dann, wenn du sie ben\u00f6tigst. Wenn dein Team oder dein Projekt nicht gen\u00fcgend Genomdaten generiert, um eine Vollzeitstelle f\u00fcr einen Bioinformatiker zu rechtfertigen, ist die Inanspruchnahme externer Hilfe der zeit- und kosteneffizienteste Ansatz.<\/li>
  3. Bei\u00a0GreenGate Genomics<\/strong>\u00a0bekommst du Hilfe von einem\u00a0Team<\/strong>\u00a0von bioinformatischen Experten, welche eine gro\u00dfe Bandbreite von speziellen Kompetenzern abdecken.<\/li>
  4. Einen Bioinformatiker zu besch\u00e4ftigen, bedeutet zus\u00e4tzlichen Verwaltungs- und Managementaufwand. Ein Bioinformatiker kann zudem jederzeit k\u00fcndigen, w\u00e4hrend die Zusammenarbeit mit einem externen Dienstleister dir einen zuverl\u00e4ssigen Partner garantiert, der bei Bedarf liefert.<\/li><\/ol><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t
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    Bei GreenGate Genomics konzentrieren wir uns auf die bioinformatische Datenanalyse im Bereich der Umwelt- und Molekularmikrobiologie. Wir verf\u00fcgen \u00fcber umfangreiche Erfahrung in diesen Bereichen und sind davon \u00fcberzeugt, dass wir uns von anderen Anbietern insbesondere durch unser Know-how bei der Arbeit mit Genomdatens\u00e4tzen aus anspruchsvollen Umweltproben abheben. Dennoch verf\u00fcgen wir \u00fcber das Fachwissen und die Kapazit\u00e4ten, um Genomdaten aus einer Vielzahl von Quellen und Proben zu verarbeiten. Jedes Projekt ist einzigartig. Wenn du mehr dar\u00fcber erfahren m\u00f6chten, welche Art von Analysen wir durchgef\u00fchrt haben, besuche unsere\u00a0Fallstudien\u00a0<\/a>- Seite oder kontaktiere uns direkt via\u00a0info@greengategenomics.com<\/a>\u00a0oder unserem Kontaktformular.<\/p><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t

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    Work With Us\n<\/h2>\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t
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    Die Kosten f\u00fcr eine von uns durchgef\u00fchrte Analyse oder eine von uns entwickelte Pipeline h\u00e4ngen vom Datenumfang, der Art der Analyse und weiteren Anforderungen ab, die am besten in einem kurzen Gespr\u00e4ch gekl\u00e4rt werden k\u00f6nnen. Wenn du an einer Zusammenarbeit mit uns interessiert bist, sende uns bitte eine kurze E-Mail mit deiner Anfrage (z. B. Art der Analyse, Anzahl der Proben usw.). Je nach Umfang deiner Anfrage senden wir dir umgehend einen Kostenvoranschlag zu. Andernfalls vereinbaren wir gerne einen kurzen (kostenlosen) Termin mit dir, um weitere Details zu deinem Projekt zu besprechen. Auf Grundlage dieses Gespr\u00e4chs erstellen wir dir dann ein Angebot f\u00fcr die von dir gew\u00fcnschte Dienstleistung.<\/p><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t

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    GreenGate Genomics respektiert deine Privatsph\u00e4re, erhebt keinen Anspruch auf die Daten und gibt diese nicht an Dritte weiter. Auf Wunsch schlie\u00dfen wir eine Geheimhaltungsvereinbarung (Non-Disclosure Agreement - NDA) ab, die die Weitergabe und Nutzung deine Daten reguliert.<\/p><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t

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    Das Endergebnis eines Projekts h\u00e4ngt von den zu Beginn vereinbarten Leistungen ab. Im Falle einer bioinformatischen Analyse stellen wir dir verschiedene Arten von Tabellen und Abbildungen sowie Beschreibungen der verwendeten Arbeitsabl\u00e4ufe zur Verf\u00fcgung. Diese Informationen erh\u00e4ltst du in Form eines Berichts oder auf Wunsch als einzelne Dateien.<\/p>

    Sollten wir einen Workflow bzw. eine Pipeline f\u00fcr dich entwickelt haben, stellen wir dir die erforderlichen Dateien zur Verf\u00fcgung, damit du die Software auf deinem Computer installieren kannst. Es gibt verschiedene M\u00f6glichkeiten, wie dir die Software bereitgestellt werden kann (Docker, Conda), wor\u00fcber wir uns zu Beginn abstimmen werden. Dar\u00fcber hinaus stellen wir dir die entsprechende Dokumentation zur Software zur Verf\u00fcgung und bieten eine Schulung an, um dich bei der Installation zu unterst\u00fctzen, dich mit der Anwendung vertraut zu machen und dir bei der Fehlerbehebung zur Seite zu stehen.<\/p><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t

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    Wir \u00fcbernehmen die Analyse f\u00fcr dich, verlangen jedoch\u00a0keine<\/strong>\u00a0Co-Autorschaft. Falls m\u00f6glich, sollte im Abschnitt \u201eMethodik\u201c erw\u00e4hnt werden, dass die Daten von einem externen Dienstleister, GreenGate Genomics, verarbeitet wurden. Wenn du m\u00f6chtest, dass wir dich bei der Erstellung des Manuskripts unterst\u00fctzen und zur Interpretation der Daten beitragen, helfen wir dir gerne weiter und k\u00f6nnen dann als Co-Autor aufgef\u00fchrt werden. Eine Liste der von uns verfassten oder mitverfassten Artikel findst du\u00a0hier.<\/a>\u00a0Bitte besprich diese Details bei unserem Beratungsgespr\u00e4ch mit uns, damit wir deinem W\u00fcnschen gerecht werden k\u00f6nnen.<\/p><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t

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    Hol dir ein Angebot f\u00fcr dein Projekt<\/h2>\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t
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    \n\t\t\t\t\t\n\t\t\t\t\t\t\n\t\t\t\t\t\t\t\t\tHier geht es los<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/a>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

    DEU GREENGATE GENOMICS Frequently Asked Questions About Us services Expertise Working with us About Us About GreenGate Genomics GreenGate Genomics is a biotechnology start-up in Potsdam, Germany. 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